应与细菌性肺炎、病毒性肺炎、衣原体肺炎、军团菌肺炎鉴别：典型者可通过发病年龄、起病急缓、痰的颜色、痰涂片、胸部X线等检查加以初步鉴别。各型不典型肺炎的临床鉴别较困难，最终的鉴别均需病原学检查。与嗜酸性粒细胞增多性肺浸润鉴别：肺炎支原体肺炎患者外周血嗜酸性粒细胞数正常，而嗜酸性粒细胞增多性肺浸润患者外周血嗜酸性粒细胞异常增加。