肺脓肿发病主要是由于病原体入侵机体引起，根据病原体入侵的方式不同，病因主要分为以下三种：吸入病原体病原体经口、鼻、咽腔吸入致病。在麻醉、醉酒、药物过量、癫痫、脑血管意外、受寒、极度疲劳等诱因存在时，机体免疫力低下，吸入病原体会引起肺脓肿。鼻窦炎、牙槽脓肿等疾病的脓性分泌物，被吸入肺部后也会致病。继发于某些疾病某些细菌性肺炎，如金黄色葡萄球菌、铜绿假单胞菌和肺炎克雷伯菌肺炎等可以继发肺脓肿。支气管扩张症、支气管囊肿、支气管肺癌、肺结核空洞等继发感染也可以引起肺脓肿。支气管异物阻塞是引起儿童肺脓肿的重要因素。肺部周围器官的化脓性病变，如阿米巴肝脓肿、膈下脓肿、肾周围脓肿、脊柱脓肿、食管穿孔等也可以引起肺脓肿。病原体经血液播散皮肤外伤感染、疖、痈、中耳炎或骨髓炎等引起的脓毒症，病原体会经血液播散到肺部，引起肺脓肿。静脉吸毒者也容易引起肺脓肿。