确诊肝肿瘤需进行实验室及影像学检查。原发性肝癌肝癌血清标志物检测：甲胎蛋白（AFP）和血液酶学以及其他肿瘤标志物如癌胚抗原（CEA）、糖链抗原CA199等呈阳性。影像学检查：超声检查：可显示肿瘤的大小、形态、所在部位以及肝静脉或门静脉内有无癌栓，其诊断符合率可达90%；CT检查：具有较高的分辨率，肝癌诊断符合率可达90%以上，可检出直径1.0cm左右微小癌灶；磁共振成像（MRI）检查：诊断价值与CT相仿，对良、恶性肝内占位病变，特别是血管瘤的鉴别优于CT；选择性腹腔动脉或肝动脉造影检查：对血管丰富的癌肿，其分辨率低限约1cm，对小于2.0cm的小肝癌其阳性率可达90%；肝穿刺行针吸细胞学检查：在B超引导下行细针穿刺，有助于提高阳性率；正电子发射型计算机断层成像（PET）：可在发病早期，根据疾病引起的局部组织代谢改变发现病灶，有助于良、恶性肝脏占位病变的鉴别，特别在判断治疗后肝内有无癌组织残留、有无复发及肝外脏器转移等方面具有重要价值，但因价格较为昂贵，目前该检查一般不作为首选。继发性肝癌大多数继发性肝癌患者视原发肿瘤不同，肿瘤标志物各异。少数来自胃、食管、胰腺及卵巢的肝转移癌则可有甲胎蛋白的升高。有症状者多伴有碱性磷酸酶（ALP）、谷氨酰转肽酶（GGT）升高。癌胚抗原升高有助于肝转移癌的诊断，结直肠癌肝转移时癌胚抗原阳性率高达60%～70%。CT表现为混合不匀等密度或低密度占位，典型的呈现“牛眼征”；磁共振成像检查肝转移癌常显示信号强度均匀、边清、多发，少数有“靶征”或“亮环征”。肝海绵状血管瘤主要依靠影像学检查，包括X线、B超、磁共振成像、CT检查。其中磁共振成像特别是强化磁共振成像，对本病诊断最有价值，特异性达92%～100%。