韦尼克脑病主要针对病因进行治疗。病因治疗最为重要，慢性酒中毒患者，应立即静脉滴注维生素B1。发病初期快速非肠道补充维生素B1可完全恢复。伴意识障碍的慢性酒中毒、营养不良、低血糖和肝病等的患者，静脉输入葡萄糖前应通过非肠道补充维生素B1，防止诱发韦尼克脑病。慢性酒中毒所致的韦尼克脑病，患者可伴镁缺乏，镁缺乏可降低维生素B1的作用，使病情恶化，故应补镁。