确诊脑血吸虫病主要依靠粪便检查、血常规、脑脊液检查、血和脑脊液免疫学检查、脑部CT检查等帮助确诊。粪便检查通过粪便中寻找虫卵或孵化出毛蚴。血常规检查白细胞、嗜酸粒细胞等有无异常，嗜酸粒细胞增多为本病的特点之一。脑脊液检查脑脊液中有无虫卵及其他异常。免疫学检查皮内试验、环卵沉淀试验、间接血凝试验、酶联免疫吸附试验等检查都可以应用。脑部CT通过CT检查颅内病变情况。