脑血吸虫病目前主要通过一般治疗、药物治疗、手术治疗。一般治疗应注意休息、加强支持治疗。药物治疗驱虫治疗，常用药物为吡喹酮，不但可以杀死成虫，尚可杀灭虫卵并抑制虫卵肉芽肿生长。有脑水肿、颅内高压表现者应以甘露醇脱水治疗。有癫痫发作者，应用抗癫痫药物治疗，以控制发作。其他药物，如有非特异性炎性表现可以使用类固醇激素等。手术治疗有大的占位性肉芽肿、明显临床症状者可施行开颅手术切除。开颅减压术或脑室-腹腔引流术，适用于脑部炎症水肿造成急性颅内压增高、有脑脊液循环阻塞或脑疝形成而脱水剂疗效不能持续或无效时。