治疗上主要消除诱因。不同年龄和严重程度的直肠脱垂有不同治疗方法。儿童直肠脱垂一般5岁前可自愈。成人的黏膜脱垂一般使用硬化剂注射治疗。成人的完全性直肠脱垂大多会进行手术治疗。一般治疗养成良好排便习惯。排便后立刻把脱出的直肠托回肛门内。积极治疗便秘、咳嗽等疾病。胶布贴合法胶布贴合法用于治疗儿童早期直肠脱垂。药物治疗注射硬化剂使直肠与周围组织粘在一起。常用硬化剂为石炭酸植物油、盐酸奎宁尿素水溶液，对老人和儿童疗效好，对成年人效果不理想。手术治疗不同手术方法各有优缺点和不同的复发率。手术途径有4种：经腹部、经会阴、经腹会阴和经骶部。直肠悬吊固定术损伤小，痛苦少，术后恢复快，并发症少。直肠黏膜脱垂可做痔环行切除术。年老、体质虚弱者可做肛门环缩术。