特发性甲旁减尚需与下列疾病鉴别：假性甲状旁腺功能减退症（PHP）：本病是一种具有以低钙血症和高磷血症为特征的显性或隐性遗传性疾病，可分为Ⅰ型与Ⅱ型。典型病人可伴有发育异常、智力发育迟缓、体态矮胖、脸圆，可见掌骨（跖骨）缩短，特别是对称性第4与第5掌骨缩短。严重低镁血症（血清镁低于0.4mmol/L）：病人也可出现低血钙与手足搐搦，血清PTH可降低。但低镁纠正后，低钙血症迅即恢复，血清PTH也立即增加至正常。其他 ：如代谢性或呼吸性碱中毒、维生素D缺乏、肾功能不全、慢性腹泻、钙吸收不良等，应加以鉴别。