医生诊断骶尾部藏毛窦，主要依据病史、典型症状、体征、影像学检查和超声检查。有久坐、肥胖、骶尾部外伤史。典型症状即骶尾部急性浅表脓肿，破溃后为一窦道，反复破溃，经久难愈。囊肿内常含毛发，伴肉芽组织。探针检查可探入3～4cm，有的可探入更深，远端为盲端，不与直肠相通。造影可了解藏毛窦的范围、深度及走向。X线检查可鉴别骨质破坏性疾病（结核）及骶尾部畸胎瘤。腔内超声可鉴别诊断骶尾部藏毛窦和肛瘘。