溃疡型肠结核肠壁的淋巴组织呈充血、水肿及炎症渗出性病变，进一步发展为干酪样坏死，随后形成溃疡。溃疡边缘不规则，可深达肌层或浆膜层。增生型肠结核病变多局限在回盲部，可有大量结核肉芽肿和纤维组织增生，可引起梗阻。混合型肠结核兼有以上两种病变，称为混合型或溃疡-增生型肠结核。