淋病主要发生在泌尿生殖系统，但是也会感染到其他的器官，男性和女性感染淋病后，症状有所不同。男性淋病尿道口红肿、外翻。排尿疼痛、尿频、尿急。尿道痒。尿道口有分泌物。龟头、包皮红肿。女性淋病阴道分泌物增多。外阴瘙痒和烧灼感。尿频、尿急、尿痛，尿道口充血、触痛。一侧的大阴唇隆起，有红、肿、热、痛。下腹坠痛。腰背疼痛。肛周红肿。如果淋球菌性感染到其他部位，也会出现相应的症状。淋球菌性结膜炎眼部疼痛。结膜充血、水肿。眼部脓性分泌物。淋球菌性咽炎咽干不适、咽部疼痛。吞咽困难、吞咽痛。咽喉部红肿。咽喉部有脓性分泌物。淋球菌性直肠炎肛门瘙痒。肛门烧灼感。肛门疼痛或坠胀感。排便困难。排便有黏液或脓性分泌物。播散型淋病（较少见）发热。乏力。食欲下降。