传染性软疣的治疗方法主要是手术治疗，也可以使用物理治疗和药物治疗。手术治疗主要的治疗方法是疣体夹除术。通过手术可以去除软疣小体，达到根治的目的。物理治疗常用的物理方法有冷冻、激光、电灼等。通过物理治疗可以去除疣体，消除皮肤出现的丘疹和结节。药物治疗常见的药物有酞丁胺软膏、西多福韦软膏等，这些药物有抑制病毒的作用。如果有感染，需要先使用药物控制感染，再进行手术治疗。