医生诊断扁平疣，主要依据临床表现，结合组织病理学检查。本病好发于于儿童和成年人，呈慢性发病。皮损好发于面部、手背及前臂、颈和上胸部，为粟粒至绿豆大小的略凸出皮面的扁平丘疹，数目不定，一般无自觉症状，偶有轻痒。组织病理学检查结果显示角化过度及棘细胞层肥厚，表皮突可略延伸，表皮细胞尤其棘细胞层浅部及颗粒层有显著的空泡细胞，细胞中央的细胞核凝缩；角质层因角质细胞有很大的空泡而呈网袋形。有助于确诊。