医生通过临床表现、体格检查、实验室检查、膀胱镜检查及影像学检查来确诊肾结核。临床表现部分病人体格检查有明显的结核病灶，或存在抗炎治疗久不痊愈的膀胱炎或尿频、血尿、腰痛等症状。可考虑肾结核的可能。实验室检查尿常规检查检查尿液的酸碱性与其中白细胞和脓细胞含量相关情况符合肾结核的病理变化。尿液结核菌检查通过相关结核杆菌检查，可知尿液中存在结核分枝杆菌。对肾结核的诊断有重要参考意义。膀胱镜检查膀胱镜检查显示膀胱内存在典型结核病变。基本可以确立肾结核的诊断。影像学检查X线或CT表现出典型的结核图像，可确立肾结核的诊断。