肛管癌有时单从症状很难与其他疾病相鉴别，必须去医院接受正规检查后才能确诊。本病需要与直肠癌、直肠息肉、痔、肛瘘和肛周湿疹等相鉴别。可通过内镜检查，特别是活检后病理学检查进行诊断。