根据肿瘤的部位、有无周围组织器官浸润和淋巴结转移确定治疗方式。包括手术治疗、放射治疗和化学治疗。局部切除术仅适用于早期肛管癌，表现为肿瘤表浅、直径小、活动性好、无远处转移和局部浸润、细胞分化较高。经腹会阴联合切除术适用于肿瘤直径较大、固定、细胞分化差、有周围组织器官浸润者。须作人工肛门。放疗和化疗在该病治疗中具有重要地位。放疗和化疗可以有效提高患者的生存期。