确诊肠炎需要进行病原学、影像学、内镜检查。病原学检查通过血液、呕吐物、粪便培养，培养出病原体即可确诊，但培养需要3～5天。血常规显示中性粒细胞或嗜酸性粒细胞增多可提示有关病原体感染。影像学检查经肛门注入空气和钡剂后，拍X线，可发现相关病变，但急性期不宜使用。内窥镜检查先禁食并吃泻药排空肠道，经肛门进入一根软镜，可以直观呈现肠道情况，了解炎症的部位和性质，必要时还可取组织做病理学检查。