颅底凹陷症与延髓、脊髓空洞症，后颅窝或枕骨大孔区占位性病变，多发性硬化及脑干、小脑、后组脑神经、脊髓损伤所引起的疾病有相似的症状，医生需要通过实验室检查、影像学检查等进行区别。当出现颈枕部疼痛、活动受限，吞咽困难、饮水呛咳等表现时，不要自行诊断和用药，以免延误病情，应该及时到医院就诊。