本病的致病菌为：葡萄球菌、链球菌、肺炎双球菌或大肠埃希菌等。血行感染患有肺脓肿、脓胸、支气管扩张、急性细菌性心内膜炎、亚急性细菌性心内膜炎等疾病时，致病菌可经血液侵入脑部，导致脑脓肿。头部感染灶蔓延头部外伤、颅脑手术后等，如果发生致病菌感染，也会引发脑脓肿。中耳炎、乳突炎、鼻窦炎、颅骨骨髓炎、颅内静脉窦炎以及面部感染等化脓性感染病灶，可直接向脑内蔓延，形成脑脓肿。