肾结石的治疗应该以消除症状、去除结石、保护肾功能、处理病因和预防复发为原则，实施个体化疗法。主要有以下治疗方法。保守治疗一般光滑、直径6毫米以下的小结石，可先使用保守疗法（多喝水，调整饮食等）。病因治疗对于病因明确的肾结石首先要处理病因，如甲状旁腺功能亢进，如发现肿瘤，则需切除肿瘤；尿路梗阻者，要解除梗阻；感染性结石，要根除感染等。对症治疗止痛，解痉，利尿，排石，控制感染等。体外冲击波治疗直径在1厘米以下的肾结石，可以考虑体外冲击波治疗。利用冲击波在结石局部所产生的一系列物理学效应将结石粉碎。手术治疗当疼痛不能被药物缓解或结石直径较大时，应考虑采取外科手术治疗措施。目的是将结石取出或者将其击碎成小颗粒排除体外。