咽旁脓肿多由溶血性链球菌致病，其次为金黄色葡萄球菌、肺炎链球菌。导致咽旁隙感染的原因主要有以下几种：邻近组织或器官的化脓性炎症急性扁桃体炎、急性咽炎及颈椎、乳突等部位的急性感染。扁桃体周脓肿、咽后脓肿等直接溃破或蔓延至咽旁隙。咽部外伤及异物医源性的操作损伤如扁桃体切除、拔牙、局部注射、内镜检查损伤导致咽旁隙感染。咽壁的异物刺伤、外伤。经血流和淋巴系感染邻近器官或组织的感染，经血行和淋巴系累及咽旁隙。