自身免疫性肝炎可能是遗传和环境等因素相互作用的结果，使得机体产生针对自身肝脏的抗体或免疫细胞，攻击肝细胞，导致肝脏发生坏死、变性等，逐步发展为肝纤维化、肝硬化和肝衰竭。遗传因素本病属于多基因遗传病，携带某些基因的人，容易在环境因素下诱发疾病。环境因素微生物感染：病毒、细菌等，尤其是甲、乙、丙型肝炎病毒和单纯疱疹病毒感染等更容易诱发本病。药物：甲基多巴、呋喃妥因、双氯芬酸、干扰素、匹莫林、米诺环素、阿托伐他汀和某些中草药可诱发本病。