绝大多数输尿管结石来源于肾脏。肾结石移行到输尿管。体外震波后结石碎块下落到输尿管。一些输尿管疾病，可导致尿液瘀滞在输尿管，尿液积聚处可形成结石。如：肾盂输尿管连接部狭窄、输尿管息肉、输尿管肿瘤、输尿管口囊肿、输尿管狭窄、输尿管憩室、巨输尿管症。