肾囊肿主要和肾脏的其他囊肿性疾病相鉴别，比如遗传性多囊肾、囊性肾癌、髓质海绵肾、肾积水等。如果超声检查发现肾囊肿，需要到泌尿外科进一步就诊检查。医生主要通过CT平扫加增强等检查，检查排除其他疾病，做出诊断。