重症肌无力的治疗主要有药物治疗、重症肌无力危象治疗和胸腺治疗。药物治疗主要是为了缓解疾病进展，保持正常的生理功能。药物治疗常用的有胆碱酯酶抑制药 （如甲基硫酸新斯的明、吡啶斯的明等） 、免疫抑制药 （如糖皮质激素、硫唑嘌呤、甲氨蝶呤和环磷酰胺等） 、静脉注射免疫球蛋白和血浆置换疗法。小剂量、长期服用耐受性良好，无严重不良反应。重症肌无力危象治疗为了稳定生命体征。及时行人工辅助呼吸，包括正压呼吸、气管插管和气管切开，并监测动脉血气分析中的血氧饱和度和二氧化碳分压变化。若无法获得满意疗效可考虑甲泼尼龙冲击疗法，部分患者还可考虑同时应用血浆置换或大剂量丙种球蛋白冲击治疗。病因治疗由于胸腺瘤或者胸腺增生会出现重症肌无力，胸腺治疗适用于伴发胸腺肿瘤、胸腺增生患者，70%患者经胸腺治疗可以缓解病情，甚至治愈。常用的胸腺治疗方法有胸腺手术切除和胸腺放射治疗。